Biopower filtruje wodę trójfazowo – moduł wlotowy wyposażony jest we wkład z gąbki, mamy zatem tutaj typowy prefiltr (filtr wstępny).
Następne zamknięte moduły zawierają wkład do filtracji biologicznej – sprawdzony w boju Eheim SubstratPro.
Wymuszony konstrukcją filtra dość silny przepływ wody powoduje odpowiednie natlenienie złoża biologicznego. Na drobno porowatej powierzchni kulek swoją pracę wykonują osiadłe tam bakterie nitryfikacyjne, do czego niezbędny jest im właśnie tlen.
Ostatnią warstwą filtracyjną jest ponownie gąbka, którą jednak w razie potrzeby można zastąpić włókniną.